Calypso wordt over het algemeen beschouwd als de nimfendochter van Atlas door een naamloze vrouw; hoewel in andere oude bronnen een Calypso wordt genoemd als een Oceanid, dochter van Oceanus en Thetys, en een Nereid, dochter van Nereus en Doris, hoewel dit drie verschillende Calypso's kunnen zijn.

De nimfendochters van Atlas werden tot de mooiste van alle onsterfelijke godinnen gerekend, en Calypso was daarop geen uitzondering. Calypso toonde haar schoonheid echter niet als deel van het gevolg van een van de bekendere godinnen, zoals veel andere nimfen, want Calypso had haar thuis op het eiland Ogygia (mogelijk het eiland Gozo).

Calypso werd bekend toen de Griekse held Odysseus op Ogygia aankwam.

Odysseus had al veel beproevingen moeten doorstaan op zijn terugreis uit Troje. De laatste tegenslag voor Odysseus was het verlies van zijn laatste schip en mannen, toen Zeus ze had vernietigd om Helios gunstig te stemmen.

Odysseus had het overleefd door een vlot te maken van de restanten van zijn schip. Negen dagen lang had Odysseus gedobberd en gepeddeld, voordat hij op de tiende dag aanspoelde op de kustlijn van Ogygia.

Ondanks de schoonheid van zijn metgezel en zijn omgeving beschouwde Odysseus Ogygia gewoon als een gevangenis, en Odysseus zou er verscheidene jaren blijven. De duur van Odysseus' opsluiting was volgens Homerus zeven jaar, hoewel anderen zeggen dat Odysseus slechts één of vijf jaar op Ogygia was.

Uiteindelijk kwam de godin Athena, die een bondgenoot van Odysseus was, de Griekse held te hulp, want Athena ging naar haar vader Zeus om hem te vragen Calypso te bevelen haar gevangen geliefde vrij te laten. Zeus willigde Athena's verzoek in en Hermes werd erop uitgestuurd om Zeus' bevel door te geven.

Hoewel Calypso blij was met de komst van Hermes, was ze niet blij met het nieuws dat de boodschappergod bracht. Calypso vond dat ze oneerlijk behandeld werd, want het leek haar dat de mannelijke goden van de berg Olympus konden doen en laten wat ze wilden met stervelingen, terwijl godinnen niet dezelfde vrijheid hadden. Natuurlijk had Zeus zelf Ganymedes en de Trojaanse prins was nog steeds te vinden op de berg Olympus waar hij de ambrosia en nectar serveerde.

Maar uiteindelijk had Calypso geen keus en dus vertelde de godin Odysseus dat hij nu vrij was om te vertrekken. Calypso zou Odysseus inderdaad voorzien van materiaal voor een nieuwe boot en proviand voor een lange reis over zee. Dus in korte tijd liet Odysseus Ogygia en Calypso achter zich.